宋元道藏，經元代焚經和兵火之災，早已散失。明英宗正統年間形成《正統道藏》，五千三百零五卷。後又有《萬曆續道藏》一百八十卷。清代《道藏輯要》與《道藏續編》第一集，均有增補。道藏內容極為龐雜，除道經外，還有諸子百家及醫學、化學、生物、保健、天文、地理等大量論著，是中國文化史一大資料庫。

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明世宗一度尊崇道教，以道士邵元節總領道教。並躬親齋醮。清代對道教逐漸清淡，張天師由二品降為五品。道光停止張天師朝覲。官方道教從此一蹶不振。但道教的神學觀點和齋醮超度、祈禳福禍、符咒驅邪等活動，卻深入民間，滲入秘密宗教中，為民俗的一部分。在道佛教共同影響下，形成以玉皇大帝為首的天宮天神系統，以太上老君為首的散仙真人系統，以如來佛為首的西方極樂世界，以閻羅、城隍、土地等組成的陰間鬼神系統，還有各種妖魔鬼怪。這些宗教神話有廣泛影響，並滲入《西遊記》、《紅樓夢》、《聊齋志異》等文學作品之中。道教勸善書《太上感應篇》、《陰騭文》、《功過格》三種，在封建社會後期流行極廣。其中《功過格》是一種自我反省日記，逐日紀錄功過，一月一小比，一年一大比，善則繼之，過則改之。道教依靠這些簡便易行的道書，為宣傳普及封建道德，起過不可忽視的作用。